Việc bẻ khóa iPhone, mặc dù làm mất hiệu lực bảo hành của bạn, sẽ không ngăn bạn tiếp tục sử dụng tất cả các ứng dụng bạn đã mua thông qua iTunes App Store. Thay vào đó, quá trình này thêm một cửa hàng ứng dụng thay thế, Cydia, vào điện thoại của bạn, hoạt động cùng với App Store chính thức. Mặc dù bản thân việc bẻ khóa sẽ không xóa các ứng dụng cũ của bạn, nhưng quá trình này đôi khi có thể yêu cầu bạn khôi phục hệ điều hành của điện thoại, buộc bạn phải khôi phục ứng dụng của mình từ bản sao lưu hoặc tải xuống lại chúng.
Quy trình bẻ khóa thông thường
Khi bạn chạy tiện ích bẻ khóa trên máy tính, phần mềm sẽ gửi các lệnh khác nhau đến điện thoại của bạn. Trong quá trình này, điện thoại của bạn có thể khởi động lại nhiều lần. Sau khi quá trình bẻ khóa kết thúc, điện thoại của bạn sẽ vẫn có tất cả các ứng dụng cũ trên đó, cộng với ứng dụng Cydia. Bạn có thể tải xuống ứng dụng và chỉnh sửa hệ thống từ Cydia trong khi tiếp tục mua ứng dụng từ iTunes App Store.
Sử dụng iTunes
Ngay cả sau khi bẻ khóa, bạn vẫn có thể tiếp tục đồng bộ hóa với iTunes trên máy tính của mình. Quá trình đồng bộ hóa sẽ không thay đổi hoặc xóa các ứng dụng App Store của bạn cũng như các ứng dụng Cydia của bạn. Tuy nhiên, trong một số trường hợp, các chỉnh sửa từ Cydia có thể khiến các ứng dụng xuất hiện không đúng trên iTunes. Ví dụ: nếu bạn ẩn ứng dụng trên điện thoại của mình bằng cách sử dụng tinh chỉnh bẻ khóa, chúng sẽ vẫn xuất hiện trên iTunes trên máy tính của bạn. Mặc dù có sự mâu thuẫn, đồng bộ hóa sẽ hoạt động chính xác.
Rủi ro tiềm ẩn
Cả việc bẻ khóa bản thân và cài đặt ứng dụng từ Cydia đều có nguy cơ làm hỏng hệ thống điện thoại của bạn. Nếu điều này xảy ra, bạn sẽ cần khôi phục điện thoại bằng iTunes. Mặc dù bạn sẽ không bao giờ mất quyền truy cập vào các ứng dụng đã mua của mình - bạn luôn có thể tải xuống lại các ứng dụng bạn đã trả tiền - quá trình này sẽ xóa dữ liệu ứng dụng của bạn, khôi phục dữ liệu đó về ngày đồng bộ hóa cuối cùng của bạn. Để tránh mất dữ liệu, hãy luôn đồng bộ hóa điện thoại của bạn trước khi bẻ khóa hoặc thử nghiệm các ứng dụng bẻ khóa mới.
Mất ứng dụng Cydia
Mặc dù bẻ khóa sẽ không xóa các ứng dụng trên App Store, nhưng việc cập nhật hệ thống, khôi phục hoặc bẻ khóa lại điện thoại sẽ xóa tất cả các ứng dụng được tải xuống từ Cydia. Sau khi bẻ khóa mới, bạn sẽ phải tải lại tất cả các ứng dụng như vậy. Các ứng dụng trả phí vẫn gắn liền với tài khoản Cydia của bạn, vì vậy bạn không phải trả phí nữa. Bạn cũng có thể cài đặt các ứng dụng sao lưu Cydia như PKGBackup hoặc xBackup để sao lưu và khôi phục tất cả các ứng dụng Cydia của bạn cùng một lúc.